政府採購高端疫苗爭議未解，民進黨總統候選人、副總統賴清德在選前突然贊成公開高端疫苗採購合約，引發議論。對此，民眾黨總統參選人質疑，到了大選投票前幾天「被逼問，你才說應該要公開合約？」早在2022年10月31日高端就公布價格了，這中間1年多「你身為副總統，都不作聲？」
柯文哲在臉書發文提到：「高端疫苗採購合約封存30年，前衛福部長陳時中出來說，這叫『保存30年』；12月30日的總統候選人辯論會上，賴清德說，『這個時候把合約公開，我認為，人民有知道的權利，也可以避免不斷惡意的攻擊。』」
柯文哲質問賴清德：「到了大選投票前幾天，被逼問，你才說應該要公開合約？你的理由是，因為高端已經公開價格了，其實早在2022年10月31日，高端就公布價格了，這中間1年多，你身為副總統，都不作聲？」
柯文哲指出：「在辯論會上，我說『當時提供給立委審閱的重要項目，全部塗黑』，你還敢回答『立法院也已經調閱過』，請問塗黑了，怎麼完整調閱？疫苗合約關鍵資料塗黑、高端釋放不實的利多消息，股價異常波動、或用免疫橋接取代三期試驗，最後一大堆人出國時需要補打疫苗，你都不作聲。」
柯文哲直言：「你我都是醫界出身，我實在無法理解，攸關人命，你位居副總統高位，怎能沒有道德勇氣至此！身為台大校友，卡管案時你是行政院長，在辯論會上還敢邀功說：管中閔能夠擔任校長，『也是在我擔任院長的時間內核定』，你是要大家，包含管校長，向你感恩戴德？」
柯文哲呼籲：「不要為了短期利益犧牲長期利益，不要為了少數人的利益犧牲多數人利益，不要為了政黨利益犧牲國家利益。再過10天，我們有機會選擇一個新政治文化，擺脫藍綠泥淖，然後，讓這些人好好深自反省。」
